ČeskyEnglish

Popis předmětu - A6M33MOS

Přehled studia | Přehled oborů | Všechny skupiny předmětů | Všechny předměty | Seznam rolí | Vysvětlivky               Návod
A6M33MOS Modelování a simulace Rozsah výuky:2+2c
Garanti:Kofránek J. Role:P Zakončení:Z,ZK
Vyučující:Kofránek J.
Zodpovědná katedra:13133 Kreditů:5 Semestr:Z

Anotace:

Modelovací techniky často používané v Biomedicínském inženýrství a odpovídající programové nástroje: Matlab - Simulink, Modelica. Technologie modelování a procesy s tím související. Typy modelů, modely spojitého a diskrétního času, modely lineární a nelineární se soustředěnými parametry a jejich realizace v programovém prostředí. Formalizace a vytvoření modelu k zvolenému systému, jeho identifikace, verifikace a interpretace. Rovnovážné stavy (homeostáza) a jejich vyšetřování simulacemi. Modely rozpojených a zpětnovazebních systémů. Použití fuzzy-neuronových modelů v biomedicíně. Modely jednotlivých systémů i celých soustav definovaných v Biomedicínském inženýrství. Modely buněčných a fyziologických regulací, modely populací. Aplikace modelů při tvorbě umělých orgánů. MÍSTO VÝUKY: Výuka v ZS 2014-15 bude probíhat na 1.LF UK, U nemocnice 4, učebna DEKP2, přízemí, číslo dveří 1.26.(přednášky St. - prednaska: St 12:45-14:15), U nemocnice 5, Oddělení biokybernetiky, Ústav patologické fyziologie, (cvičení St 14:30-16:00, St 16:15-17:45).

Výsledek studentské ankety předmětu je zde: A6M33MOS

Osnovy přednášek:

1. Matematické modelování v Biomedicínském inženýrství - příklady formulace modelů fyziologických systémů.
2. Statická analýza fyziologických systémů a procesů - příklady řízení srdečního výdeje, regulace glykémie, regulace acidobazické rovnováhy, chemická regulace ventilace.
3. Analýza lineárních regulačních procesů fyziologických systémů v časové oblasti - linearizovaný model mechaniky dýchání, dynamika neuromuskulárního reflexního oblouku.
4. Analýza lineárních regulačních procesů fyziologických systémů ve frekvenční oblasti. Frekvenční odpověď modelů regulace cirkulace a regulace glykémie.
5. Způsoby identifikace fyziologických regulačních systémů, experimenty se Starlingovým preparátem srdce-plíce, Kaovy experimenty s překříženou cirkulací, řízená perfúze mozku pro rozdělení centrálních a periferních chemoreceptorů, galvanický clamp, otevření pupilární reflexní smyčky, technika zpětného dýchání (rebreathing). Minimální model regulace glukózy, identifikace parametrů regulace dýchání.
6. Vyšetřování stability fyziologických procesů: analýza stability pupilárního reflexu, model Cheyne-Stokesova dýchání, homeostáza.
7. Problémy optimalizace v biologických systémech: regulace dechového vzoru, řízení aortální pulzové vlny, adaptivní řízení fyziologických proměnných - adaptivní tlumení fluktuací arteriálního PCO2.
8. Metody nelineární analýzy fyziologických regulačních systémů - modelování srdečních arytmií, periodické dýchání s apnoe. Modely dynamiky neuronů: Hodgkin-Huxleyův model, Bonhoeffer-van der Polův model.
9. Popisy komplexní dynamiky ve fyziologických regulačních systémech - spontánní variabilita, logistická rovnice, regulace density neutrofilů, model kardiovaskulární variability, model cirkadiálních rytmů. Model spánkové apnoe.
10. Formulace a použití fuzzy modelování při neúplné informaci o fyziologických dějích.
11. Modelování fyziologických systémů a procesů neuronovými sítěmi.
12. Přehled modelů na buněčné, orgánové i systémové úrovni. Diskuse jejich použitelnosti.
13. Struktura a způsoby rozšiřitelnosti interaktivního katalogu Biomedicínských modelů.
14. Rezerva.

Osnovy cvičení:

Kromě pravidelných ukázek modelů ve cvičeních, dostane každý student zadanou individuální úlohu, vycházející z měření na biologickém objektu, zpracování naměřených dat, návrhu modelu, jeho identifikaci, verifikaci a interpretaci. Modely budou koncipovány i v režimu reálného času. Způsob kontroly 3x za semestr, vypracování potřebné dokumentace a obhájení individuální úlohy před ostatními studenty. Udělení zápočtu i známka u zkoušky bude stanovena na základě bodového ohodnocení průběžných aktivit studenta po výuku předmětu, výsledku písemné a ústní části zkoušky.

Literatura:

[1] Jang, J.S.R., Sun, C.T., Mizutani E.: Neuro-fuzzy and Soft Computing, 1997. Prentice Hall.
[2] Biomedical Engineering - Handbook,1995, CRC Press, Inc.
[3] Biomedical Modeling and Simulation on PC, Springer - Verlag, New York, 1993.
[4] Eck,V., Razím.M.: Biokybernetika , Skripta ČVUT, Praha 1996.
[5] Karban,P.: Výpočty a simulace v programech Matlab a Simulink, Computer Press,a.s., Brno, 2006.
[6] Onderka P.:Systém pro prezentaci modelů, počítačová dokumentace, Praha 2009.
[7] Murray, J.D.:Mathematical Biology I,II, Spatial Models and Biomedical Applicatios, Springer, 2002, 2003.
[8] Michael C. K. Kho: Physiological Control Systems. Analysis, Simulation and Estimation. IEE Press, New York, 2000, ISBN 0-7803-3408-6.
[9] Hugh R. Wilson: Spikes, Decisions and Actions. Dynamical foundation of neuroscience. Oxford University Press, Oxford, 1999, ISBN 0-19-852430-7.
[10] Frank C. Hoppensteadt, Charles S. Peskin: Modeling and Simulation in Medicine and the Life Sciences. Springer 2000,ISBN 0-387-95072-9.
[11] Robert D. Strum, Donald E. Kirk: Contemporary Linear Systems using Matlab. PWS Publishing Company, Boston, 1999, ISBN: 0-534-94710-7.
[12] Keener,J Sneyd,J: Mathematical Physiology. Springer, New York, Berlin, 1998, ISBN 0-387.98381-3.

Požadavky:

Webová stránka:

http://cw.felk.cvut.cz/doku.php/courses/a6m33mos/start

Předmět je zahrnut do těchto studijních plánů:

Plán Obor Role Dop. semestr
MPBIO1 Biomedicínská informatika P 3
MPBIO2 Biomedicínské inženýrství P 3


Stránka vytvořena 25.9.2017 12:47:26, semestry: L/2016-7, Z,L/2017-8, Z/2018-9, připomínky k informační náplni zasílejte správci studijních plánů Návrh a realizace: I. Halaška (K336), J. Novák (K336)
Za obsah odpovídá: doc. Ing. Ivan Jelínek, CSc.